于谦家被抄的时侯，其家无余资，唯独有一室上了锁，打开看一看，原来是景泰帝所赐的蟒衣、剑器也，这是当年京城保卫战结束后，景泰帝赏赐的，于谦深藏家中，从来不在别人面前展示。
石亨与曹吉祥、徐有贞等人”丧心病狂“地建议将于谦所荐举诸文武大臣一并诛杀，以斩草除根，然而，于谦虽死，朝堂上毕竟还是有明白人，此议终究未在朝廷能过。
于谦死后，石亨党羽陈汝言代为兵部尚书，未满一年，赃累巨万。英宗皇帝召大臣入视，愀然曰：“于谦被遇景泰朝，死无余资。汝言抑何多也！“石亨俯首不能对。
越数日，英宗皇帝击毬内苑，恭顺侯吴瑾、抚宁伯朱永等数勋旧随侍，石亨、张軏、张輗自外来，未及至御前，英宗皇帝遥见石亨等人，连以毬戳地曰：“好个于谦！”如此者数声。恭顺侯吴瑾、抚宁伯朱永等皆流汗沾背，战慄无所措。恭顺侯吴瑾回家后，对亲人曰：“观上意，亨辈将无所逃矣。”
后来边关屡有蒙古入侵的警报传来，英宗皇帝忧形于色。恭顺侯吴瑾侍，进言曰：“使于谦在，当不令寇至此。“英宗皇帝也无言以对。有人故意质问吴瑾曰：“君先前犯事，为于谦所劾，何顾为于谦美言耶？”吴瑾大声曰：“岂可以私家之怨，而废天下之公议耶？
后来，徐有贞为石亨所攻击，被派去戍守金齿(今云南保山)。又过了数年，石亨亦犯罪死在狱中，曹吉祥更意图谋反，试图再来一遍”夺门之变“，幸有恭顺侯吴瑾英勇捐躯，才平定此乱，曹吉祥诛连九族，此天道好还之明验也。
英宗皇帝晚年也知自己杀错了于谦，他与李贤有一场对话，充分说明了所谓”夺门之变“就是一场闹剧。英宗皇帝复问李贤“夺门”事。李贤曰：“‘迎驾’则可，‘夺门’岂可示后？天位乃陛下固有，‘夺’即非顺。且尔时幸而成功，万一事机先露，亨等不足惜，不审置陛下何地！英宗皇帝悟曰：“然。”
李贤曰：“若郕王果不起，群臣表请陛下复位，安用扰攘为？此辈又安所得邀升赏，招权纳贿安自起？老成耆旧依然在职，何至有杀戮降黜之事致干天象？《易》曰‘开国承家，小人勿用’，正谓此也。”英宗皇帝曰：“然。”于是，他下诏自今章奏勿用“夺门”字，并议革冒功者四千余人。
至成化初年，诸被革者诉请。宪宗皇帝用李贤言，夺太平侯张瑾、兴济伯杨宗爵，此举大快人心。于冕赦归，上疏讼冤，得复官赐祭。诰曰：“当国家之多难，保社稷以无虞，惟公道之独恃，为权奸所并嫉。在先帝已知其枉，而朕心实怜其忠。“天下传诵焉。
成化三年，皇帝特旨令天下有司烧毁奸党榜文，尽复榜内被诬者官秩，间有复起而大用者；弘治二年，凤阳府学训导储衍奏公功绩卓著，宜赐赠谥，立庙祭祀，言甚垦切。礼部将上其事，给事中孙孺议奏：“古之节义若诸葛亮在汉、张巡在唐、岳飞、文天祥在宋，今之节义若少保于谦，俱合一体祭祀，表励将来。”蒙朝廷岁赐一祭于乡民所立之祠。
于冕痛念于谦未蒙赠谥，寻复乞恩于上，事下礼部，礼部议得：“古今人臣能为国家建大议，成大功者，生则有旌耀之恩，死则有褒恤之典。若前宋岳飞尽忠报国，死非其罪，其追谥祠祀在宋就已举行。于谦受冤虽同，而功业所就则大过之，宜如其子所请。”
有司春秋祭祀，其文曰：“逢时艰危，安内攘外。社稷之功，世永不忘。”仍赐赠谥诰命，其略曰：“当皇祖北狩之时，正国步艰危之日，乃能殚竭心膂，保障家邦，回銮有期，论功应赏。不幸为权奸所构，乃殒其身，舆论咸冤，恤恩已锡，兹复赠特进光禄大夫、柱国、太傅（与太师、太保俗称三公，正一品，多为死后追封），谥肃愍，用昭旌崇之典。”天语丁宁，垂之万世，朝廷始终恩典，虽天地之广大，何足以尽之。
弘治六年，浙江布政使刘大夏莅位之初，即祀公于杭州郡学乡贤祠。弘治十年，巡按御史姚寿为公建忠节坊牌于城隍祠下，以表彰之，盖皆知所重云。万历中，改谥忠肃。杭州、河南、山西皆世奉祀不绝。
于谦祠在东城区西裱褙胡同二十三号，明清鼎革之时曾经被毁，光绪时重建；现为市重点保护文物；自天顺八年（公元一千四百六十四年）至今，已有五百多年的时间，于谦祠屡毁屡建，现存的为同冶八年（公元一千八百六十九年）时建。
胡子睿前世时曾经在杭州西湖游玩时，去过于谦祠，进门便可看到“丹心托月”牌楼；经过步道后，来到正门，大门门联“两袖清风昭万世，一轮明月耀三台！”，门匾题着黑底金字的“于忠肃公祠”，正门上高悬“百世一人”匾额，门联则有思想家林则徐题写的“公论久而后定；何处更得此人”。
大殿正中有一块石灰模型，让胡子睿不禁联想起于谦的《石灰吟》；他看见殿后门联为“双手扶明光日月；一心救国壮山河”。
胡子睿走出大殿，便进了庭院，正中处置有由生铁制成的“镇河铁犀”，胡子睿目测此物高约二米，宽约三三米，铁犀背上铸有于谦撰写的《镇河铁犀铭》：“百炼玄金，溶为金流，变幻灵犀，雄威赫奕，填御堤防，波涛永息，安若泰山，固若磐石，水怪潜形，冯夷敛迹，城府坚完，民无垫溺，雨顺风调，男耕女织，四时循序，百神效职，亿万闾阎，施之衽席，惟天之俯，惟帝之力，尔亦有庸，传之无极。”
原来这是当年于谦在冶理黄河时铸造的宝物，原型在河南开封铁牛村，后人仿造后置于此，以表达对于谦的纪念之情。庭院中原来有忠泉，是康熙乙亥年中，改建于谦祠时发现，以“公之大忠诚，如水之在地中”而命名。